Иммунный агранулоцитоз обусловлен появлением аутоантител (например, при системной красной волчанке) и антител к гранулоцитам после приема медикаментов (так называемых гаптенов). Гаптенами являются медикаменты, которые при попадании в организм соединяются с белком и обретают свойства антигена. Гаптеновый агранулоцитоз вызывают диамокс, амидопирин, антипирин, ацетилсалициловая кислота, барбитураты, изониазид (тубазид), мепробамат, фенацетин, бутадион, плазмохин, индометацин, левамизол, сульфаниламиды, бисептол, хлорохин, антидиабетические сульфаниламидные препараты, инсектициды (средства от насекомых).
Механизм развития агранулоцитоза изучен недостаточно. При аутоиммунных формах поражения преждевременная гибель гранулоцитов и их костномозговых предшественников обусловлена аутоантителами. Сам механизм индивидуальной реакции организма на попадание медикамента при гаптеновом агранулоцитозе еще не ясен. 

Характерно, что, однажды возникнув, гаптеновый агранулоцитоз будет неизменно повторяться при введении в организм того же препарата – гаптена. Клинические проявления обусловлены самим агранулоцитозом (т. е. резким снижением числа лейкоцитов, клеток-защитников). Поэтому типичны септические осложнения: ангины, пневмонии и т. п. При лабораторном исследовании гранулоциты в крови не обнаруживаются, но число лимфоцитов, тромбоцитов, ретикулоцитов нормальное. Кровотечений и кровоизлияний не бывает. 

Изредка возможно появление антител и к тромбоцитам, тогда возникает тромбоцитопеническая геморрагическая пурпура. Прогноз аутоиммунного агранулоцитоза определяется основными заболеваниями (системной красной волчанкой, ревматоидным артритом и т. п.). Гаптеновый агранулоцитоз дает высокий процент смертельных исходов (до 80 %). Прогноз резко отягощается при повторных попаданиях гаптенов в организм. Поскольку нередко очень трудно установить, какой именно лекарственный препарат явился гаптеном, то приходится пожизненно исключить из употребления все подозреваемые медикаменты. Именно это правило является главной профилактической мерой повторных агранулоцитозов гаптенового типа.
Иммунные гемолитические анемии
Это анемии, которые вызываются воздействием антител на эритроциты. Имеется несколько форм иммунных гемолитических анемий. Это аутоиммунные анемии, обусловленные образованием в организме антител против собственных эритроцитов; гаптеновые, вызванные фиксацией на эритроцитах чуждых для организма антигенов-гапетнов (лекарств, вирусов и т. п.) с антителами, образованными в ответ на соединение гаптена с белком организма; изоиммунные, связанные с попаданием в организм новорожденного антител матери, направленных против эритроцитов ребенка (при несовместимости ребенка и матери по Rh-фактору и гораздо реже по группе крови).